北京基因組所生命與健康大數(shù)據(jù)研究獲進(jìn)展

來源：北京基因組研究所 時(shí)間：2018-01-11 11:49:38 作者：

　　1月4日，《國際核酸研究》（Nucleic Acids Research）數(shù)據(jù)庫專刊，連登四篇中國科學(xué)院北京基因組研究所生命與健康大數(shù)據(jù)研究成果，包括生命組學(xué)數(shù)據(jù)資源建設(shè)成果（D14-20）、實(shí)時(shí)定量PCR內(nèi)參基因知識(shí)庫——ICG（Internal Control Genes；D121-126），甲基化數(shù)據(jù)庫Methbank升級版（D288-295）以及基因組序列變異庫——GVM（Genome Variation Map；D944-949）。四篇文章的發(fā)表，標(biāo)志著我國綜合型生物信息資源庫建設(shè)獲得國際同行進(jìn)一步認(rèn)可。

　　自上世紀(jì)60年代以來，國際生物信息學(xué)家建立了一系列的數(shù)據(jù)庫。特別是上世紀(jì)90年代，隨著人類基因組計(jì)劃的展開以及網(wǎng)絡(luò)在全球普及，數(shù)據(jù)庫數(shù)量和體量迅猛增加，形成了以NCBI、EBI、DDBJ等為代表的多個(gè)國際大數(shù)據(jù)中心。隨著測序技術(shù)不斷發(fā)展，我國已成為國際基因組數(shù)據(jù)最大產(chǎn)出國之一，但我國產(chǎn)出的組學(xué)數(shù)據(jù)絕大部分必須提交到國外數(shù)據(jù)庫才能得到認(rèn)可。據(jù)Database Commons數(shù)據(jù)庫統(tǒng)計(jì)，我國數(shù)據(jù)庫資源總數(shù)已位居世界第二，但大部分?jǐn)?shù)據(jù)庫沒有進(jìn)行長期運(yùn)行維護(hù)，嚴(yán)重缺乏深度人工審編，數(shù)據(jù)庫內(nèi)容邊緣化，最終結(jié)果是大量數(shù)據(jù)庫資源質(zhì)量不高，利用率低。

　　北京基因組所面向國家大數(shù)據(jù)發(fā)展戰(zhàn)略和科技創(chuàng)新戰(zhàn)略，成立生命與健康大數(shù)據(jù)中心，建立生物大數(shù)據(jù)儲(chǔ)存、整合與挖掘分析研究體系，構(gòu)建的GSA（Genome Sequence Archive）數(shù)據(jù)庫已開展原始組學(xué)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)與共享服務(wù)，并與國際接軌，存儲(chǔ)的數(shù)據(jù)已支持Cell、Nature Communications、PNAS、Genome Research等雜志文章發(fā)表，建成我國生物大數(shù)據(jù)匯交共享平臺(tái)，成為繼NCBI、EBI、DDBJ之后第四個(gè)綜合基因組權(quán)威數(shù)據(jù)庫。同時(shí)，建成生物大數(shù)據(jù)多層次組學(xué)層面的數(shù)據(jù)資源體系，包括基因組歸檔數(shù)據(jù)庫Genome Warehouse、基因組變異數(shù)據(jù)庫Genome Variation Map、基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫Gene Expression Nebulas、甲基化數(shù)據(jù)庫Methylation Bank、生物知識(shí)庫Science Wikis，對我國科學(xué)研究和產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新發(fā)展起到了重要支撐作用。

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責(zé)任編輯：陳近梅